16世纪的西班牙,无畏的大将军托马斯·克里奥奉皇后伊莎贝拉之命前往探索新大陆,以求得创世纪中提及的“生命之树”。传说中记载,只要饮下一滴树的汁液,便会获得永生。一路历尽千辛万苦,战胜叛变的下属、怨恨的仇家、涂着油彩的玛雅人,托马斯终于到达了一座辉煌的隐蔽之地,在那里他看到了永生难忘的奇异景象。2000年,医学家汤米·克里奥(休·杰克曼饰)急切地为心爱的妻子丽兹(蕾切尔·薇姿饰)寻找着治疗脑癌的良药,虽然身为脑癌专家,可他却只能看着病入膏肓的妻子束手无策。可奇迹发生了,汤米的研究小组从南美洲丛林里带回了一株奇异的树种标本,在提炼药物用于黑猩猩实验的时候,药物奇迹般地产生了效果。500年后的遥远未来,光头、瘦削的汤姆·克里奥乘坐着用思想控制的透明圆球飞船中,穿梭于太空宇宙,他将去往一个未知的星云,那是传说中玛雅人深信的灵冥世界。辽阔的星际间,汤姆身边却只有那棵已快死亡的古树,他无时无刻不回想着关于丽兹的记忆。